(jeśli nie zaznaczono inaczej, nagrania studyjne)
2013
Idźmy! Śpiewy powstańcze 1863
[CD], Poznań 2013
2012
Dumy staropolskie
[CD], Poznań 2012
Blokomachia. Piosenki z lat osiemdziesiątych
[CD], Żnin 2012
2011
Patrz tam, gdzie Sarmacja [płyta CD live]
[CD], Kraków 2011 [dodatek do „Polonia Christiana”]
2010
Kolędowanie staropolskie
[CD], bd. [Poznań 2010]
Historie dominikańskie
[CD], Kraków 2010
Grunwald 1410 po Kowalsku
[CD], Poznań 2010
Nie masz pana nad ułana [płyta CD live – zapis koncertu emitowanego na żywo ze Studio im. Agnieszki Osieckiej 11 listopada 2008]
[CD], bd [Warszawa 2010]
2009
Wojna i Miłość
[CD], Warszawa 2009
2008
Niezbędnik konfederata barskiego [płyta załączona do książki tegoż tytułu]
[CD], Poznań 2008
2006
Niezbędnik Sarmaty [płyta załączona do książki tegoż tytułu]
[CD], Poznań 2006
2005
Otruta markiza. Stare ballady francuskie po polsku
[CD], Hamburg 2005
Jacek Kaczmarski, Jacek Kowalski, Dwie Sarmacje [dodatek do „Christianitas” z grudnia 2005; zapis koncertu ze stycznia 1995 roku]
[CD], Poznań 2005
2004
Hey, hey, hey. Kolędy staropolskie
[CD], Poznań 2004 [dodatek do „Christianitas” z grudnia 2004]
2003
Rycerze Dobrej Opieki. Pieśni wypraw krzyżowych po polsku
[CD], Kraków 2003
Serce i rozum [płyta CD live]
[CD], Kraków 2003
1999
Pieśń o bitwie Pod Grunwaldem [broszura i płyta CD] [dwujęzyczna, polsko-francuska edycja zabytku staropolskiego],
opr. i wyk. J. Kowalski, T. Dobrzański, Poznań-Warszawa 1999
1998
Konfederacja barska po Kowalsku
[CD], Kraków 1998
1997
Trubadurzy i truwerzy po polsku
[kaseta], Kraków 1997
1993
Opowieść o Persewalu i świętym kielichu Graalu [baśń muzyczna]
[kaseta], Kraków 1993
1991
Śpiewniczek sarmacki Jacka Kowalskiego
[kaseta – nowe nagranie], Kraków 1991
1990
Simfonie Dawidowe
[kaseta], Kraków 1990
1988
Śpiewniczek Sarmacki Jacka Kowalskiego
[kaseta – publikacja drugiego obiegu], Kraków 1988